Background: Worldwide, Peru has one of the highest infection fatality rates of COVID-19, and its capital city, Lima, accumulates roughly 50% of diagnosed cases. Despite surveillance efforts to assess the extent of the pandemic, reported cases and deaths only capture a fraction of its impact due to COVID-19 0 s broad clinical spectrum. This study aimed to estimate the seroprevalence of SARS-CoV-2 in Lima, stratified by age, sex, region, socioeconomic status (SES), overcrowding, and symptoms. Methods: We conducted a multi-stage, population-based serosurvey in Lima, between June 28th and July 9th, 2020, after 115 days of the index case and after the first peak cases. We collected whole blood samples by finger-prick and applied a structured questionnaire. A point-of-care rapid serological test assessed IgM and IgG antibodies against SARS-CoV-2. Seroprevalence estimates were adjusted by sampling weights and test performance. Additionally, we performed RT-PCR molecular assays to seronegatives and estimated the infection prevalence. Findings: We enrolled 3212 participants from 797 households and 241 sample clusters from Lima in the analysis. The SARS-CoV-2 seroprevalence was 20¢8% (95%CI 17¢2À23¢5), and the prevalence was 25¢2% (95%CI 22¢5À28¢2). Seroprevalence was equally distributed by sex (aPR=0¢96 [95%CI 0¢85À1¢09, p = 0¢547]) and across all age groups, including 60 versus 11 years old (aPR=0¢96 [95%CI 0¢73À1¢27, p = 0¢783]). A gradual decrease in SES was associated with higher seroprevalence (aPR=3¢41 [95%CI 1¢90À6¢12, p<0¢001] in low SES). Also, a gradual increase in the overcrowding index was associated with higher seroprevalence (aPR=1¢99 [95%CI 1¢41À2¢81, p<0¢001] in the fourth quartile). Seroprevalence was also associated with contact with a suspected or confirmed COVID-19 case, whether a household member (48¢9%, aPR=2¢67 [95%CI 2¢06À3¢47, p<0¢001]), other family members (27¢3%, aPR=1¢66 [95%CI 1¢15À2¢40, p = 0¢008]) or a workmate (34¢1%, aPR=2¢26 [95%CI 1¢53À3¢35, p<0¢001]). More than half of seropositive participants reported never having had symptoms (56¢1%, 95% CI 49¢7À62¢3). Interpretation: This first estimate of SARS-CoV-2 seroprevalence in Lima shows an intense transmission scenario, despite the government's numerous interventions early established. Susceptibles across age groups show that physical distancing interventions must not be relaxed. SES and overcrowding households are associated with seroprevalence. This study highlights the importance of considering the existing social inequalities for implementing the response to control transmission in low-and middle-income countries.
Objetivos: Estandarizar una prueba RT-LAMP in house para la detección de SARS-CoV-2 y validarla con muestras de laboratorio y de campo en pacientes con sospecha clínica de COVID-19. Materiales y métodos: Se estandarizó una prueba molecular RT-LAMP in house para la detección de SARS-CoV-2 estableciéndose el límite de detección con células Vero de cepas peruanas aisladas de SARS-CoV-2. Se validó la prueba en laboratorio con 384 muestras de hisopado nasal y faríngeo (HNF) obtenidas entre marzo y julio de 2020. Para la validación de campo se obtuvieron muestras de HNF de 383 casos sintomáticos sospechosos de COVID-19. Todas las muestras fueron evaluadas por RT-LAMP y RT-qPCR. Para la validación de laboratorio y de campo se consideró como estándar de referencia al RT-qPCR, se calcularon medidas de concordancia y rendimiento diagnóstico. Resultados: El límite de detección fue consistente en los casos con umbral de ciclo (Ct) Ct 30 en ambas pruebas, mostrando eficiencia para detectar hasta 1000 copias/μL del gen diana. Se evidenció robustez con la mitad de las concentraciones de cebadores y 20 μL de volumen final. Se identificó ausencia de amplificación para otros coronavirus humanos. La concordancia en laboratorio obtuvo un Kappa de 0,88 (IC 95%: 0,83–0,93) y en campo fue de 0,89 (IC 95%: 0,84−0,94); la sensibilidad en laboratorio fue de 87,4% (IC 95%: 80,8−92,4) y en campo fue de 88,1% (IC 95%: 81,6−92,9), la especificidad en ambos escenarios fue de 98,8% (IC 95%: 96,4−99,7). Conclusiones: La prueba RT-LAMP in house fue validada por presentar una adecuada robustez, sin reacciones cruzadas, buena concordancia y rendimiento diagnóstico comparado con el RT-qPCR.
expresado la necesidad de mapear la prevalencia de las parasitosis en América Latina y el Caribe. En el Perú no existen estudios que hayan medido la prevalencia de dicha patología. Objetivos. Determinar la frecuencia de parasitosis general y por tipo de helmintos en el año 2017 y la tendencia de los últimos 8 años previos, años a nivel nacional y por departamento. Métodos. Análisis de base de datos secundaria (Sistema de Información de Salud: HIS) del 2010 a 2017, que contiene el registro de las atenciones en los establecimientos de salud del Ministerio de Salud. Para el análisis de tendencias se utilizó modelos de regresión segmentada. Resultados. A nivel nacional la parasitosis general y por helmintos fue de 4,9% y de 3,3% respectivamente en el 2017; ambas presentaron una tendencia descendente, reduciéndose cada año 8,8% y 11,3% respectivamente. Igual ocurrió en el 68% (17/25) de las regiones, presentando una mayor reducción porcentual anual Amazonas, Huánuco, La Libertad, Cajamarca y Huancavelica. Áscaris y enterobiasis se presentaron con mayor frecuencia, representando en el 2017 cada una el 0,3%. Conclusiones. La prevalencia de parasitosis general, por grupo de helmintos y por tipo específico de helmintos, es menor a lo reportado en otros estudios, los cuales se realizaron en población escolar a diferencia de este estudio, el cual se realizó en población general donde el 57,2% fueron mayores de 18 años que acudieron a un establecimiento de salud.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.