BackgroundMolecular typing of pathogen populations is an important tool for the development of effective strategies for disease control. Diverse molecular markers have been used to characterize populations of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam), the main bacterial pathogen of cassava. Recently, diversity and population dynamics of Xam in the Colombian Caribbean coast were estimated using AFLPs, where populations were found to be dynamic, diverse and with haplotypes unstable across time. Aiming to examine the current state of pathogen populations located in the Colombian Eastern Plains, we also used AFLP markers and we evaluated the usefulness of Variable Number Tandem Repeats (VNTRs) as new molecular markers for the study of Xam populations.ResultsThe population analyses showed that AFLP and VNTR provide a detailed and congruent description of Xam populations from the Colombian Eastern Plains. These two typing strategies clearly separated strains from the Colombian Eastern Plains into distinct populations probably because of geographical distance. Although the majority of analyses were congruent between typing markers, fewer VNTRs were needed to detect a higher number of genetic populations of the pathogen as well as a higher genetic flow among sampled locations than those detected by AFLPs.ConclusionsThis study shows the advantages of VNTRs over AFLPs in the surveillance of pathogen populations and suggests the implementation of VNTRs in studies that involve large numbers of Xam isolates in order to obtain a more detailed overview of the pathogen to improve the strategies for disease control.

<p>La dispersión de la enfermedad del Moko en un cultivo comercial de plátano se determinó a partir de un análisis de la incidencia en cuadrantes conformados por ejes de ocho plantas a partir de una planta enferma erradicada (foco). Se identificaron colonias de <em>Ralstonia solanacearum </em>en muestras de agua y suelo procedentes de 12 puntos por cuadrante, en cuatro muestreos realizados los días 0, 45, 90 y 135. Los aislamientos que formaron colonias típicas fluidas (F), pequeñas redondas fluidas (SFR) y variantes afluidas (AFV), fueron sometidos a pruebas bioquímicas, análisis molecular (PCR), reacción de hipersensibilidad en hojas de tabaco y patogenicidad sobre plantas jóvenes de plátano. La enfermedad se incrementó de 8 a 10, 12 y 38 plantas en promedio por cuadrante y muestreo. En tres de los cuadrantes la incidencia se restringió al área más cercana al foco, mientras que en el otro hubo una dispersión mayor. El número promedio de colonias típicas (F) aisladas varió de 54 el día 0 a 114, 142 y 90 en los muestreos subsiguientes. El número de unidades formadoras de colonia por gramo de suelo (UFC/g) de los tipos F y SFR siempre fue menor que el de colonias AFV; las de tipo F tendieron a disminuir a partir del tercer muestreo (día 90) registrando un leve aumento en el cuarto (día 135). Por su parte, el número de UFC/g tipo SFR aumentó en los muestreos segundo y tercero y se redujo en el último. El número de UFC/g de tipo AFV, aunque 10 veces más abundante que los otros tipos, presentó un comportamiento similar al de las colonias SFR y su disminución fue más drástica al final. Las colonias tipo F fueron más frecuentes en cercanías del foco, lo que coincidió con el incremento de plantas enfermas, mientras que las colonias tipo AFV predominaron en las áreas intermedias. La amplificación de segmentos de ADN por PCR (<em>Oli1 </em>– <em>Y2</em>) confirmó los resultados de las caracterizaciones bioquímica, de hipersensibilidad y patogénica. Las colonias tipo F presentaron mayor número de respuestas positivas que las SFR y AFV a cada una de las pruebas, incluyendo la de patogenicidad.</p><p><strong> </strong></p><p><strong>Dispersion of Ralstonia solanacearum in soils cultivated with plantain in the 'Piedemonte Llanero' (Colombia)</strong></p><p>In order to analyze the dispersion of ‘Moko’ disease in a commercial plantain cultivation, quadrants were defined conformed by the axes of eight plants from a removed diseased plant (focus). It was possible to identify Ralstonia solanacearum in samples of water and soil originated from 12 points per quadrant, in four samplings performed on days 0, 45, 90 and 135. The isolates that formed typical fluid colonies (F), small fluid rounds (SFR) and non-fluid variants (NFV), were subjected to biochemical tests, molecular analysis (PCR), hypersensitivity reactions on tobacco leaves and pathogenicity on young plantain plants. The disease increased from an average of 8 to 10, 12 and 38 plants per quadrant over sampling time. In three quadrants the incidence was restricted to the area closest to the focus, whereas in the other there was a greater dispersion. The average number of typical colonies (F) isolated varied from 54 at day 0 to 114, 142 and 90 in subsequent samplings. The number of forming colony units per gram of soil (FCU/g) of the types F and SFR was always less than for NFV colonies; those of type F tended to decrease from the third sampling (day 90) and then registered a slight increase in the fourth (day 135). On their part, the number of FCU/g of type SFR increased in the second and third samplings and decreased in the last. The number of FCU/g of type NFV, although ten times more abundant than the other types, presented a similar behavior to the type SFR and its decrease was more drastic at the end. Type F colonies were more frequent in the immediate focus areas, which coincided with the increase of diseased plants, whereas type NFV colonies predominated in intermediate areas. The amplification of DNA segments by PCR (Oli1 – Y2) confirmed the results of the biochemical, hypersensitivity and pathogenicity characterizations. Type F colonies showed a larger number of positive responses than SFR and NFV to each of the tests, including pathogenicity.</p>

RESUMEN Las dos enfermedades más limitantes para el cultivo del caucho en Colombia son el Mal Suramericano de las hojas, ocasionado por Microcyclus ulei y la antracnosis, por Colletotrichum spp. Estos patógenos afectan los tejidos foliares, que bajo condiciones favorables pueden llegar a ocasionar la defoliación total de los árboles. A hojas sanas y enfermas del clon GT1 en distintos estados fenológicos se les realizaron cortes histológicos, los cuales fueron sometidos a tinción doble de safranina-green, previo a la toma de fotografías bajo el microscopio de luz. En las hojas sanas se observó la organización de los tejidos, apreciándose que las hojas adultas presentan una capa fina de ceras, ausente en las hojas jóvenes. Los estados juveniles de las hojas infectadas por M. ulei presentaron degradación y desorganización de la epidermis, parénquima (empalizada y esponjoso) y haces vasculares, mientras que en las hojas adultas se evidenció la formación de estromas acompañada por la desaparición de la epidermis, alargamiento y lignificación de las células del parénquima de empalizada y lignificación parcial. Las hojas en estados juveniles infectadas por Colletotrichum spp. presentaron hundimientos en la epidermis, acompañado por la presencia de lignina; las hojas en estado adulto mostraron depresiones pronunciadas con fuerte lignificación y degradación del parénquima esponjoso o el de empalizada y en ocasiones ambos. En algunas células del mesófilo se observaron hifas y conidias del hongo. En conclusión, se observó que la infección por estos dos patógenos ocasiona daños histológicos de diferente grado, los cuales varían con la edad del tejido y en concordancia con los síntomas visuales.

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El caucho natural (Hevea brasiliensis) es la base de un sistema productivo promisorio y de gran importancia para el país, que ha generado expectativas no solo alrededor del aumento del mercado, sino también en la consolidación de la industria asociada a la transformación del caucho. Esta importancia da soporte a la necesidad de mejorar la productividad, competitividad y sostenibilidad en los núcleos identificados, particularmente el del “cinturón cacaotero-cauchero de Antioquia-Córdoba”, teniendo en cuenta que estos dos departamentos cuentan con aproximadamente tres millones de hectáreas con aptitud edafoclimática para la producción de caucho natural. Esta aptitud implica la existencia de condiciones que permiten el uso eficiente de los recursos naturales, especialmente el suelo y el agua, a través de un manejo integrado del cultivo que incluye requerimientos edafoclimáticos de la especie, sistemas de siembra, plagas y enfermedades, prácticas culturales y características de la materia prima, entre otros aspectos. El Modelo productivo para el cultivo de caucho natural (Hevea brasiliensis) en el bajo Cauca antioqueño y en el sur de Córdoba busca ser una herramienta de consulta que, a partir del enfoque territorial, facilite la toma de decisiones y la priorización de inversiones por parte de los productores.